Yo creo que para google, no es indiferente, ya que es un buen ejercicio hacer estas dos comprobaciones
site:topformacion.com
site:www.topformacion.com
En este caso, vemos que son diferentes, pero porque en topformacion, tenemos subdominios para distintos centros, modalidades de cursos, tipo de masters, etc.
De igual forma, no es lo mismo que un link apunte hacia www.formaciontop.com que hacia formaciontop.com , para google son dos links diferentes cuando realmente es el mismo. Tenemos que cuidar estas cosas antes de conseguir enlaces de paginas externas.
De la misma forma, el anchor text de los enlaces tiene que ser el mismo … no es lo mismo «cursos rrhh«, que «cursos rrhh » o que «cursos rrhh.», es decir, que tenemos que ajustar el anchor text a las palabras exactas (sin espacios) que queremos posicionar.
En la herramienta para webmaster de google, es importante en el apartado Configuración, marcar la casilla de dominio preferido tal y como mostramos en este ejemplo de cursos riesgos laborales
Para poder automatizar esto en la web … lo mejor es controlarlo desde el .htaccess haciendo lo siguiente:
RewriteCond %{REQUEST_URI}\\/%{HTTP_HOST}/www. ^/+(.+/)?[^.]*[^/]\\(/)([^w][^w][^w][^.].*/(www\.)¦.*)$ [OR,NC]
RewriteCond %{HTTP_HOST}/www. ^(/)?(/)?([^w][^w][^w][^.].*/(www\.))$ [NC]
RewriteRule ^ http://%4%{HTTP_HOST}%{REQUEST_URI}%2 [L,R=301]
o utilizar otras opciones como nos comenta Carlos Rincon en su blog.
Es aconsejable en el sitemap, tambien añadir todas las direcciones con www para que google las rastree de esa forma.